البيانات الاساسيه

السيره الذاتيه

              الاسم : سامح محمد محمدي عبد الغني

عيد الميلاد : التاسع من نوفمبر 1973

المناصب :

1. محاضر في علم الأحياء المجهرية والمناعة والصحة العامة كلية الصيدلة ، جامعة بني سويف، مصر  حتى الآن .
2. رئيس وحدة رابطة الطلاب المصريين في أمريكا الشمالية (ESANA ( ) مدينة أوماها ،ولاية  نبراسكا، الولايات المتحدة الأمريكية 2009-2010
3. باحث زائر في الميكروبيولوجيا الطبية والمناعة في كلية الطب قسم المضادات الحيوية والأبحاث لمكافحة العدوى (CRAB ) جامعة كريتون، ولاية نبراسكا ، الولايات المتحدة الأمريكية 2008 – 2009.
4. باحث زائر في المركز الطبي لجامعة نبراسكا (UNMC) ، قسم علم الأمراض والأحياء الدقيقة ولاية نبراسكا، الولايات المتحدة الأمريكية 2009-2010 .
5. نائب مدير الجودة بكلية الصيدلة – جامعة بني سويف- 2011 و حتي الأن.

العنوان :

n      قسم علم الجراثيم والمناعة، كلية الصيدلة ، جامعة بني سويف. محافظة بني سويف

الشهادات :

1. بكالوريوس صيدلة . مع مرتبة الشرف ، القاهرة يونيه. 1996 .

2.      ماجستير علم الأحياء المجهرية ، القاهرة يونيه. 2005 .

3.      دكتوراه علم الأحياء الدقيقة،المقاومة البكتيرية القاهرة يونيه. 2010 .

البحوث والخبرة في مجال التدريس حاليا :

1.      معيد في علم الأحياء المجهرية في كلية الصيدلة، جامعة بني سويف، 1998-2005 .

2.      معيد في علم الأحياء المجهرية في كلية الصيدلة ،جامعة 6 أكتوبر يونيه. 1998-2005

3.      مدرس مساعد في كلية الصيدلة، جامعة بني سويف، 2005 -- 2010.

4.      محاضر في كلية الصيدلة، جامعة بني سويف، 2010  و حتى الآن .

5.      محاضر في كلية الصيدلة، جامعة النهضة، 2011  و حتى الآن.

مجالات البحوث وروتين العمل

 الكشف عن الإنزيمات الميكروبية مثل انزيمات المحللة للبكتين لاستخدامها في التطبيقات الصناعية .

1. تحديد وتوصيف وتنقية انزيمات البكتين .
2. الفحص والتقييم من المركبات المضادة للميكروبات من النباتات الطبية، وذلك بالتعاون مع قسم الكيمياء الصيدلية والعقاقير .
3. تقييم حساسية الميكروبات والكائنات الحية الدقيقة .
4. تحليل البروتين باستخدام تقنية  SDS - PAGE
5.  Iso-electro-focusing    لانزيمات β - lactamases.
6. الفحص والكشف عن الانزيمات β - lactamases.
7. التجفيد .
8. PCR العادية .
9. التفاعل التسلسلي  .PCR
10. PFGE

النشاطات التدريسية :

تدريس المقررات الدراسية التالية :

1.      علم الأحياء المجهرية ،

2.      علم الطفيليات،

3.      علم المناعة ،

4.      الأمراض المعدية ، والصحة العامة.

الأنشطة

1. حضور دورة تدريبية في دورة الإسعافات الأولية في جمعية الهلال الأحمر المصري (1996) .
2. الحضور في مؤتمر العلوم الصيدلية المصرية (القاهرة) 1996 .
3. دورة تدريبية في قسم HPLC في الهيئة العامة للرقابة علي الأدوية  (NODCAR) 1997.
4. حضور دورة تدريبية في HPLC (كلية الصيدلة و يونيه القاهرة) عام 1999 .
5. حضور ندوة  خطورة الملوثات العضوية الثابتة البيئية والصحية. 2006 .
6. ملتقي الطلاب المشاركة في الصناعة لمزيد من التعلم والتعليم (SMILE ) 2007 .
7. حضور ورشة عمل لمراقبة الجودة في الميكروبيولوجية والكيميائية السريرية قسم علم الأمراض.
8. ورشة عمل في علم الأحياء المجهرية السريرية. (مستشفى القصر العيني القاهرة يونيه) 2007 .
9. عضو الجمعية المصرية للالمطفرة البيئية .
10. عضو في الجمعية الصيدلانية المصرية .
11. حضور جميع الندوات من قسم علم الأحياء الدقيقة، كلية الصيدلة .
12. حضور دورات تنمية الموارد البشرية بنادي أعضاء هيئة التدريس .
13. حضور ندوة الدكتور جون وين بخصوص المقاومة للمضادات الحيوية في السالمونيلا تيفي وأنشطة الشبكة الدولية السالمونيلا 2007 .
14. عضو في الشبكة الدولية للسالمونيلا 2007 .
15. الحضور لورشة تدريب عمل الاحتياطات لمكافحة العدوى بأمراض الجهاز التنفسي الحادة في المدربين للرعاية الصحية، مستشفيات جامعة القاهرة سبتمبر 2007/9/11 .
16. ورشة عمل المعلوماتية الحيوية 2011.
17. حضور دورات تنمية قدرات أعضاء هيئة التدريس.
18. حضور دورات تنمية التكنولوجيه لأعضاء هيئة التدريس (Advanced Office ) .

المؤتمرات :

1. مؤتمر المضادات الميكروبيه والعلاج الكيميائي (ICAAC 2009) في سان فرانسيسكو رقم 49، كاليفورنيا ، USA.2009
2. اجتماع الجمعية العامة لطلاب ضمال أمريكا  ESANA  ، واشنطن العاصمة. 2009 .
3. مؤتمر دولي السيطرة للبحوث على العدوى- معهد تيودور بلهارس   (TBRI) بالتعاون مع مستشفى جامعة فرانكفورت الفريق العامل المشترك الماين، ألمانيا "تحديث على التحكم في العدوى لمكافحة الأمراض المعدية الناشئة" عام 2007 .

الأطروحات :

n      سامح محمد عبد الغني (2005). "دراسة حول النشاط الميكروبي بكتيناز: توصيف انزيم (ق) تشارك في تدهور البكتين والتكنولوجيا المستخدمة لتحسين الإنتاجية ونشاط انزيم" أطروحة ماجستير. كلية الصيدلة ، جامعة القاهرة .

n      سامح محمد عبد الغني (2010). "توصيف البيتالاكتاميزالمعزول من ميكروبات السالمونيلا من عينات مختلفة.”الرسالة للدكتوراه. كلية الصيدلة ، جامعة القاهرة. (في برنامج مشترك مع جامعة كريتون، في أوماها، نبراسكا، الولايات المتحدة الأمريكية)

List of Publications

عنوان رسالة الماجستير

دراسة على إنزيم البكتينيز: توصيف الإنزيم أو الإنزيمات المسئولة عن تكسير البكتين و استخدام التقنية التى تزيد من فاعلية و إنتاجية الإنزيم

ملخص رسالة الماجستير

الملخص العربي تعتبر البكتينات من أكثر المواد البناءة التي تتواجد داخل خلايا النباتات و التي تنتمي إلي مجموعة عديد السكريات، و التي تتميز بشكلها الهيكلي المعقّد ، و تقع عادةً في الطبقة الرقيقة الوسطى لجدر خلايا النباتات الراقية، و هي من الأهمية بمكان في إعطاء القوام للفاكهه و الخضراوات حيث ُتعزى التغيرات في القوام أثناء النضج و التخزين إلي التغير الحادث في تركيبة المواد البكتينية و الذي يتم ً بواسطة الإنزيمات المحللة للبكتين المتواجدة بشكل طبيعي داخل خلايا النبات . وقد تم في هذه الدراسة فصل عدد مائة عزلة مِن ْالفطريات والبكتيريا المختلفِة ذات النشاط المحلل للبكتين، و قد تم فصل تلك العزلات من الثمار ، الخضروات والبذور المتحللة ، وذلك على بيئة تحتوي علي مادّة البكتين كمصدر وحيد للكربون. و بتقدير إنتاجية هذه العزلات لإنزيم البكتينيز الميكروبي وُجد أن اثنتين و ستين عزلة تتميز بإنتاجية عالية نسبياً. و عند الكشف عن إنزيمات التحلل المائي للبكتين في المجموعة السابقة ُوجد أن إحدى وعشرين عزلة منها تتميز بإنتاجيتها العالية وعلي ذلك تم إختيارها لمزيد من الدراسة. وبتقدير إنتاجية هذه العزلات لمختلف الإنزيمات المحللة للبكتين، والتي شملت إنزيمات مثل إنزيم البولي جلاكتيورنيز، إنزيم البولي جلاكتيورنيز لييز، إنزيم البولي ميثيل جلاكتيورنيز ، إنزيم البولى ميثيل جلاكتيورنيز لييز و إنزيم البكتين استيرز، و قد وُجد أن تلك العزلات قد أنتجت هذه الإنزيمات بكميات متباينة. و قد تم إختيار العزلات ذات الإنتاجية العالية لإنزيمي البولى جلاكتيورنيز و البولي ميثيل جلاكتيورنيز و هي العزلات أرقام 94، 98 و100 ، بينما العزلات أرقام 60، 97 و العزلات أرقام 19، 38 هي من أفضل العزلات المنتجة لإنزيمي البولى جلاكتيورنيز و البولي ميثيل جلاكتيورنيز علي التوالي. وبتعريف العزلات المختارة تبين ما يلي: 1 - ثلاث عزلات فطرية تنتمي الي جنس الأسبرجيليس فيوميجيتس أرقام 19، 97 و98. 2 - ثلاث عزلات فطرية تنتمي الي جنس الأسبرجيليس نيجر أرقام 38، 94 و100. 3 - عزلة فطرية واحدة تنتمي الي جنس الأسبرجيليس كربونريس رقم 60. و قد تمت دراسة مختلف العوامل المؤثرة علي إنتاجية الفطريات المختارة لكلا الإنزيمين، و شملت العوامل التالية التأثر بنوع مصدر الكربون و النيتروجين والأس الهيدروجيني لبيئة التخمر ، معدل التقليب، زمن التخمر و درجة حرارة التخمر. و بدراسة تأثير نوع مصدر الكربون ُوجد أن إنتاج إنزيمي البولي جلاكتيورنيز و البولي ميثيل جلاكتيورنيز يتوقف بدرجة كبيرة علي نوع المصدر، و بإجراء التجارب علي سبعة عشر مصدر للكربون لتعيين إنتاجية كلا الإنزيمين وُجد أن السكروز و محلول النشا القابل للذوبانُ أعطي أعلي إنتاج لإنزيم البولي جلاكتيورنيز في جميع العزلات المختارة. أما بالنسبة لإنزيم البولي ميثيل جلاكتيورنيز فقد أدي إستخدام الكربوكسي ميثيل سليولوز إلى زيادة ملحوظة في إنتاجية بعض العزلات، كذلك عند إستخدام خليط البكتين مع حمض الأوكساليكِ أدي إلى زيادة ملحوظة في إنتاجيه إنزيم البولي ميثيل جلاكتيورنيز المفرز مِن قِبل الأسبرجيليس فيوميجيتس عزلات أرقام 19 و 98 علي وجه التحديد. أما فيما يتعَلُّق بتأثير مصدر النتروجين علي إنتاج كلاًً من إنزيمي البولي جلاكتيورنيز و البولى ميثيل جلاكتيورنيز فلقد ُوجد أن إستخدام أي من الجيلاتين ، خلاصة الخميرة ، نترات أمونيوم، كبريتات أمونيوم والبيبتون كمصدر للنتروجين قد أعطي أعلي إنتاج لإنزيم البولي جلاكتيورنيز في بعض العزلات، بينما وجد أن إستخدام أي من الحمض الأميني الألنين ، الجليسين، نترات صوديوم، قد سبَبَ إنتاجية عالية ًمن إنزيم البولي ميثيل جلاكتيورنيز المفرز من بعض العزلات. أما فيما يتعَلُّق بتأثير الأس الهيدروجيني الأولي لبيئة التخمر علي إنتاجية العزلات المختارة لإنزيمي البولي جلاكتيورنيز و البولي ميثيل جلاكتيورنيز، فقد وُجد أن الأس الهيدروجيني 4.0 و 7.0 مثالياَن لإنتاج البولي جلاكتيورنيز و البولي ميثيل جلاكتيورنيز علي التوالي. و عند تعيين تأثير معدل التقليب علي إنتاجية كلا الإنزيمين. وُجدت علاقة طردية بين معدل التقليب و إنتاجية كلا الإنزيمين بواسطة العزلات المختارة حيث وُجدت زيادة في الإنتاج عند معدل تقليب 150 لفة في الدقيقة. أما عند دراسة تأثير زمن التخمر علي إنتاج إنزيم البولي جلاكتيورنيز المفرز من العزلة رقم 98 الأسبرجيليس فيوميجيتس فقد وُجد أن الفترة من أربعة إلى ثمانية أيام مثالية للحصول علي أعلي إنتاج، و لم توُثر إطالة زمن التخمر إلى زيادة في الإنتاج. بينما في حالة إنتاج إنزيم البولي ميثيل جلاكتيورنيز فقد وجد أن أعلي إنتاج تم الحصول عليه كان في اليوم الثامن و ذلك في جميع العزلات المختارة. أما فيما يتعَلُّق بتأثير درجة حرارة التخمر علي إنتاج كلاَ الإنزيمين. فقد وُجد أنه عند درجتي حرارة 25 °و 30° م تكون إنتاجية بعض العزلات في أعلي مستوياتها. ففي العزلات المنتجة لإنزيم البولي جلاكتيورنيز، ُوجد أن درجة حرارة 30° م مُثلي لعزلات الأسبرجيليس فيوميجيتس أرقام 97 و 98. أما بالنسبة لإنزيم البولي ميثيل جلاكتيورنيز فقد كانت عزلات الأسبرجيليس نيجر أرقام 38، 94 علي مستوى عالي من الإنتاجية في درجة 25° م، بينما عزلات الأسبرجيليس فيوميجيتس أرقام 19 و 98 عند درجة 35° م. وفي دراسة العوامل المؤثرة علي نشاط الإنزيم الخامِّ اتضحت بعض النتائج التّالية: فيما يتعَلُّق بتأثير الأس الهيدروجيني علي خَلِيْط تفاعل الإنزيم، وُجد أن الأس الهيدروجيني له تأثيراً كبيراً على نشاط الإنزيم الخام المنتج من مختلف أنواع العينات المختارة. فعلى سبيل المثال وُجد أن الأس الهيدروجيني المناسب لنشاط إنزيم البولي جلاكتيورنيز في عزلات مثل الأسبرجيليس فيوميجيتس عزلة رقم 98 و الأسبرجيليس كربونريس عزلة رقم 60 عند 4.6 ، ومن ناحية أخرى كان الأسبرجيليس نيجر عزلة رقم 100 أعلى نشاطاً في الأس الهيدروجيني المتعادل. أما الأس الهيدروجيني في المدى ما بين 4 و8 كان مثاليَاً لنشاط إنزيم البولي ميثيل جلاكتيورنيز الخامِّ المفرز من الأسبرجيليس فيوميجيتس عزلة رقم 98، في حين أن عزلات الأسبرجيليس نيجر أرقام 94 و 100 كانت عند الأس الهيدروجيني 6.6. و عند دراسة تأثير درجة حرارة الاحتضان علي فاعلية الإنزيم وُجد أنه عند درجة حرارة 45°م كانت نشاطات إنزيم البولى جلاكتيورنيز المفرزة من الأسبرجيليس فيوميجيتس عزلة رقم 98 مثالية، بينما كانت نشاطات ذات الإنزيم المفرز من عزلات الأسبرجيليس كربونريس عزلة رقم60، و الأسبرجيليس نيجر عزلة رقم 100 مثالية عند درجات الحرارة 50°م - 55°م علي التوالي. كما وُجد أن درجة 45° م كانت مثالية لنشاطات إنزيم البولى ميثيل جلاكتيورنيز المفرز من الأسبرجيليس فيوميجيتس عزلة رقم 98 و الأسبرجيليس نيجر عزلة رقم 100. بينما كانت درجة حرارة 50°م من أفضل الدرجات لنشاطات إنزيم البولى ميثيل جلاكتيورنيز المفرز من الأسبرجيليس نيجر عزلة رقم 94. أما فيما يتعلق بتأثير الأملاح الذائبة على نشاط إنزيميِ البولى جلاكتيورنيز و البولى ميثيل جلاكتيورنيز الخامّ ، فلقد إتضح أن أيون عنصر الحديدوز قد سبب تنشيطاً لكلا الإنزيمين و ذلك بالنسبة لجميع العزلات، في حين أظهرت أيونات مثل النيكل، الألومنيوم، المنجنيز، الصوديوم، الماغنسيوم، الليثيوم و الكروميوم نشاطاً بدرجات متفاوتة في العزلات المختلفة ، بينما كانت أيونات عناصر مثل الكالسيوم، النحاس، الزئبق، الزنك لها تأثير مثبطاً لفاعلية كلا الإنزيمين في مختلف العزلات. وبناء علي النتائج فلقد تم إختيار الأسبرجيليس فيوميجيتس العزلة رقم 98 لمزيد من الدراسات. و عند إجراء عملية تنقية لإنزيم البولى جلاكتيورنيز الخام المُفرز خارجياً من خلايا فطر الأسبرجيليس فيوميجيتس، وذلك بإستعمال تقنية الفصل الكروماتوجرافي على السيفادكس و الداي ايثيل أمينو ايثيل السيليلوز. فقد تم فصل إنزيمين و تنقيتهما بمقدار 21.5 مرة للأول، و19.3مرة للثاني ، هذان الإنزيمان لهما نفس الوزن الجزيئي تقريبا ً( 78.75 كيلو دالتون). و قد وجد أن إنزيمي البولي جلاكتيورنيز المفصولين يحللان حمض البولي جلاكتيورونيك و كذلك البكتين و لكن بدرجة أقل. و هذا دليل علي كونهما ينتميان إلى مجموعة البولى جلاكتيورنيز و ليس البولى ميثيل جلاكتيورنيز. و بدراسة نتائج التحليل الكروماتوجرافي لخليط التفاعل ُوجد أن ناتج التحلل الوحيد هو وحدات من حمض الجلاكتيورونيك فقط، مما يدل علي أن ميكانيكية عمل الإنزيمين تنتمي إلى النوع إكسو. كذلك وُجد أن الإنزيمين لهما فاعلية عالية عند رقمي الأس الهيدروجيني 5.6 و8.3 على التوالي. كذلك ُوجد أن الحرارة المقابلة لأعلي فاعلية هي 45°م و 55°م على التوالي. كما لوحظ أن آيونات الأمونيوم، الكرميوم، الزئبقيك، الزنك، الكالسيوم ، النحاسيك و الألومنيوم ذات تأثير مثبط لفاعلية كلاَ الإنزيمين. كذلك لوحظَ أن آيوناتِ مثل الليثيوم، الصوديوم، الحديديك، الماغنسيوم، الباريوم، النيكل، البوتاسيوم و المنجنيز لها درجات متفاوته في تثبيط الفاعلية. و علي العكس من ذلك سبب أيون الحديدوز أثراً فعالاً علي زيادة فعالية كلاَ الإنزيمان.

عنوان رسالة الدكتوراه

توصيف انزيم البيتا لاكتاميز المعزول من بكتيريا السالمونيلا المفصولة من العينات المختلفة.

ملخص رسالة الدكتوراه

تعتبر بكتريا السالمونيلا (من النوع تيفيم يوريم) من أشهر أسباب حالات تسمم الأغذية عالميا. و تتسم هذه البكتريا بمقدرتها علي اكتساب تقنيات للدفاع عن نفسها ضد مختلف المضادات البكتريه, مما يعطي لها أهمية علاجيه قصوي. و في هذه الدراسة التي تم توصيف أحد أنواع المقاومة البكتيرية وهي انزيمات البيتالاكتاميز ظاهريا و جيينيا في بعض عينات السالمونيلا المختارة عن أمتلاك بعض العينات لجين سي تي اكس -14 المنتشر عالميا و المعروف بمقاومته للمضادات الحيوية من الجيل الثالث للكيفالوسبورين و خاصة مضاد السيفوتاكسيم . هذا و تتميز هذه الدراسة بأنها الأولي التي تم من خلالها تعيين و توصيف هذا النوع من الأنزيم المقاوم في بكتريا السالمونيلا في مصر. و قد توصلت النتائج لبعض العينات المنتقاة الي اكتساب هذا الميكرروب و هو السالمونيلا تيفيم يوريم احد ابرز انواع المقاومة لمضادات الكيفالوسبورين و هوانزيم السي تي اكس من النوع 14 و هو معروف و منتشر عالميا, بجانب تواجد بعض انواع أنزيمات البيتالاكتاميز المقاومة للمضادات البكترية الأخري و تشمل الأوكسا-1 و الأس اتش في-12 بجانب الأنزيمات واسعة الأنتشار و تشمل تيم-2 . و قد تم اختيار أربعة و عشرون عينه لعمل تحليل الـ PFGE لمعرفة مدي تماثل هذه العينات و تقاربها و اتضح ان العينات تندرج تحت شعبتين الشعبة الأولي و تشمل واحد و عشرون عينة تبلغ أدني نسبة تقارب لهم الـ 85 بالمائة مما يعطي انطباعا بانهم ناتيجين من سلالة واحدة بينما كانت الشعبة الثانية غير متقاربة من حيث المنشأ. أظهرت العينات الأكلينيكية المختارة مقاومة عالية للمضاد الحيوي السيفوتاكسيم بجانب انحدار مستوي الحساسية للمضاد الحيوي سيفتاذيديم.كما أظهرت عينات السالمونيلا قابلية تطبيق قواعد المعهد الأمريكي للقياسات الأكلينيكية المعملية (CLSI) لتوصيف الـ ESBL الخاصة بميكروبات الـ E. coli, Klebsiella و P.mirabilis. و عند اجراء تحليل IEF للعينات المختارة أظهرت اكتسابها لأنزيمات بيتالاكتاميز حساسة لحمض الكلافيولينك عند نقطة تحليل متعادلة 7.9 بجانب احتوائها علي انزيم ذو نقطة تحليل متعادل 5.4 بينما أظهرت العينات أرقام 68, 79, 93, 108, 115, 126 و 128 CTX-M-14من غير أدني فاعلية لأنزيمي OXA-1 أو SHV-12 . كما أظهرت العينات أرقام 92, 96, 99, 100, 102, 111, 120, و 132 فاعلية مقاومة ظاهرية خاصة بانزيم OXA-1 . ثم أخيرا أظهرت العينات أرقام 59, 65, 76, 78, 94, 95, 113, 119, و 127 فاعلية مقاومة ظاهرية خاصة بانزيم SHV-12. و عند اجراء تجربة امكانية انتقال البلازميدات الحاملة للجينات المقاومة , أمكن انتقال الجين المسئول عن انزيم ذو نقطة تحليل كهربائي متعادل 7.9 باستخدام طريقة اقتران البكتريا في كلا من العينات أرقام 68و 94 و 111. و عند اجراء التحليل الظاهري و الجزيئ باستخدام تحليل التضخم التسلسلي الـ (PCR) و تحليل الـ Sequencing PCR اثبت ان الجينات المتواجدة في العينات المختارة من النوع السي تي اكس ام-14 في العينات أرقام Sal.68, 94, 111, 113, 119, and 127 و الأوكسا -1 في العينات أرقام Sal.94, 113, 119, 127, بجانب الأس اتش في -12. في العينات أرقام Sal.102, 111, 120, 132. و تعتبر هذه الدراسة الأولي من نوعها في اثبات وجد جين من النوع السي تي اكس ام-14 في عينات السالمونيلا الأكلينيكية كما تثبت انه يمكن تطبيق قواعد المعهد الأمريكي للقياسات الأكلينيكية المعملية (CLSI) لتوصيف الـ ESBL الخاصة بميكروبات الـ E. coli, Klebsiella, and P.mirabilis. علي ميكروبات السالمونيلا هي الأخري.